Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms