Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms