Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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