Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms