Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms