Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01789 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01789 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01789 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms