Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopeO89079 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms