Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ShdO88834 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ShdO88834 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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