Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sap30O88574 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sap30O88574 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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