Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AvilO88398 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AvilO88398 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AvilO88398 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AvilO88398 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AvilO88398 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AvilO88398 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms