Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ldb2O55203 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ldb2O55203 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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