Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja1O55176 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.3 ms