Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms