Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rdh16O54909 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh16O54909 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms