Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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