Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffaO54786 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms