Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EdaO54693 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EdaO54693 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EdaO54693 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EdaO54693 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EdaO54693 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EdaO54693 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EdaO54693 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EdaO54693 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EdaO54693 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EdaO54693 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms