Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms