Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc1a6O35544 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc1a6O35544 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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