Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna6O35345 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms