Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms