Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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