Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smad6O35182 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad6O35182 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms