Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcns1O35173 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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