Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scarb2O35114 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Scarb2O35114 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Scarb2O35114 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Scarb2O35114 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Scarb2O35114 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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