Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ArxO35085 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ArxO35085 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms