Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gcm2O09102 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gcm2O09102 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gcm2O09102 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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