Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms