Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms