Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms