Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smim18J3QNP2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim18J3QNP2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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