Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm6408J3QNG1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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