Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm21972J3QN38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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