Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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