Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sgo2bJ3QMK1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sgo2bJ3QMK1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sgo2bJ3QMK1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2bJ3QMK1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sgo2bJ3QMK1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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