Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21060J3KMU4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21060J3KMU4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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