Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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