Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms