Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms