Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610008E11RikG3X964 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610008E11RikG3X964 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms