Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms