Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r176G3UW31 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r176G3UW31 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms