Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms