Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms