Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms