Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Gm28305F6U473 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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