Protein–RNA interactions for Protein: E9QMW4

Uncharacterized protein C16orf96 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9QMW4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9QMW4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9QMW4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9QMW4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms