Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms