Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms