Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms